Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARDQ03181 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARDQ03181 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms