Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN10P78369 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN10P78369 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms