Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC5P78333 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC5P78333 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC5P78333 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC5P78333 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC5P78333 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC5P78333 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC5P78333 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC5P78333 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms