Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4BP68371 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBB4BP68371 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms