Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS28P62857 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS28P62857 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS28P62857 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS28P62857 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS28P62857 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS28P62857 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS28P62857 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS28P62857 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS28P62857 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS28P62857 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms