Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms