Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GYS2P54840 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GYS2P54840 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GYS2P54840 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GYS2P54840 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GYS2P54840 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GYS2P54840 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYS2P54840 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYS2P54840 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYS2P54840 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYS2P54840 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYS2P54840 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GYS2P54840 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GYS2P54840 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GYS2P54840 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GYS2P54840 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GYS2P54840 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GYS2P54840 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GYS2P54840 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GYS2P54840 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYS2P54840 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYS2P54840 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GYS2P54840 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GYS2P54840 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms