Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF143P52747 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF143P52747 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms