Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA2P51531 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA2P51531 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA2P51531 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms