Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNA2P51530 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNA2P51530 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNA2P51530 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNA2P51530 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNA2P51530 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNA2P51530 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNA2P51530 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNA2P51530 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNA2P51530 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNA2P51530 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNA2P51530 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNA2P51530 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms