Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PPT1P50897 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PPT1P50897 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PPT1P50897 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PPT1P50897 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPT1P50897 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPT1P50897 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms