Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNBP48739 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms