Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL29P47914 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL29P47914 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL29P47914 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL29P47914 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL29P47914 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL29P47914 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL29P47914 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL29P47914 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL29P47914 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL29P47914 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL29P47914 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL29P47914 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL29P47914 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL29P47914 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms