Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A3P47895 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH1A3P47895 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms