Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN1BP46527 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms