Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR4A2P43354 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms