Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPL35P42766 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPL35P42766 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPL35P42766 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms