Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PI4KAP42356 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PI4KAP42356 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms