Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHMBP2P38935 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHMBP2P38935 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHMBP2P38935 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHMBP2P38935 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHMBP2P38935 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGHMBP2P38935 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGHMBP2P38935 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms