Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BRCA1P38398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA1P38398 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms