Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARGP37231 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGP37231 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGP37231 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGP37231 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGP37231 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARGP37231 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARGP37231 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARGP37231 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGP37231 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGP37231 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGP37231 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms