Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBP1P32455 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP1P32455 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP1P32455 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP1P32455 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP1P32455 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP1P32455 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP1P32455 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP1P32455 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP1P32455 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP1P32455 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms