Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA7P31268 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA7P31268 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA7P31268 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms