Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA6P31267 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA6P31267 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms