Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC27P30260 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC27P30260 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC27P30260 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC27P30260 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC27P30260 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC27P30260 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC27P30260 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC27P30260 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC27P30260 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms