Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECHS1P30084 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ECHS1P30084 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ECHS1P30084 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms