Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRR2P28476 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRR2P28476 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms