Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms