Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms