Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-DMAP28067 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HLA-DMAP28067 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms