Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms