Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CALB2P22676 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CALB2P22676 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALB2P22676 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALB2P22676 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALB2P22676 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALB2P22676 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALB2P22676 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALB2P22676 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALB2P22676 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALB2P22676 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALB2P22676 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALB2P22676 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALB2P22676 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALB2P22676 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms