Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACO1P21399 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACO1P21399 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACO1P21399 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACO1P21399 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACO1P21399 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACO1P21399 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACO1P21399 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms