Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB5AP20339 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB5AP20339 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms