Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB4AP20338 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB4AP20338 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms