Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM21P19474 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM21P19474 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms