Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDCP19113 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDCP19113 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDCP19113 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDCP19113 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDCP19113 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDCP19113 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDCP19113 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDCP19113 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDCP19113 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDCP19113 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDCP19113 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDCP19113 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDCP19113 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDCP19113 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDCP19113 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDCP19113 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDCP19113 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms