Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DESP17661 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DESP17661 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DESP17661 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DESP17661 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DESP17661 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DESP17661 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DESP17661 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DESP17661 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DESP17661 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DESP17661 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DESP17661 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DESP17661 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DESP17661 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DESP17661 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms