Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPB42P16452 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPB42P16452 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPB42P16452 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPB42P16452 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPB42P16452 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPB42P16452 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPB42P16452 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPB42P16452 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPB42P16452 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPB42P16452 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms