Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRF1P14222 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRF1P14222 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRF1P14222 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRF1P14222 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRF1P14222 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRF1P14222 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRF1P14222 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRF1P14222 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRF1P14222 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRF1P14222 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRF1P14222 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRF1P14222 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRF1P14222 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms