Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms