Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI1P08151 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI1P08151 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLI1P08151 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLI1P08151 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLI1P08151 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLI1P08151 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLI1P08151 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms