Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CENPBP07199 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CENPBP07199 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CENPBP07199 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CENPBP07199 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CENPBP07199 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CENPBP07199 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPBP07199 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPBP07199 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPBP07199 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPBP07199 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPBP07199 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CENPBP07199 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CENPBP07199 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CENPBP07199 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms