Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCGP05129 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCGP05129 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms