Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNAP02545 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNAP02545 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNAP02545 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNAP02545 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms