Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGHV3-33P01772 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IGHV3-33P01772 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms