Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF6BO95407 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms