Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF4AO95239 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIF4AO95239 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms