Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM1O95202 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM1O95202 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM1O95202 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM1O95202 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LETM1O95202 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LETM1O95202 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LETM1O95202 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LETM1O95202 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LETM1O95202 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LETM1O95202 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LETM1O95202 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LETM1O95202 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LETM1O95202 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LETM1O95202 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LETM1O95202 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LETM1O95202 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LETM1O95202 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LETM1O95202 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LETM1O95202 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms