Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF6O94906 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms